世界綠色組織指，假若濕紙巾含有害化學成分，一日用多次或多張濕紙巾令皮膚接觸化學品的次數增加，皮膚吸收有害物質並積聚於體內的機會亦相對增加，尤其嬰兒的皮膚較成人薄3成，頻繁地使用濕紙巾變相令嬰幼兒有機會吸收更多雌激素或類雌激素。如果長期過量吸收雌激素，更可能令女童性早熟、月經早到，增加日後患上卵巢癌、子宮內膜癌和乳癌等風險，亦影響男童日後的生殖功能，甚至出現不育。
然而，急症科專科醫生司徒敬豪醫生提醒，大家在選購時應留意產品標籤，選擇含乙醇的酒精搓手液產品，而避用含異丙醇的產品，因後者相對較難揮發，殘留在皮膚上的時間較長，若皮膚表面有破損可進入真皮層，便容易引起接觸性皮膚炎。
